ヘッダーをposition:fixedで固定すると、ページ内リンクで飛んだ先(アンカーリンク)でコンテンツがヘッダーが重なり隠れてしまい、あたかもヘッダーの高さ分のズレが生じている様に見えてしまいます。
ヘッダーの高さ分だけずらすには、cssもしくはjavascriptで調整する方法があります。
※以下、リンク先が#section01、ヘッダーの高さが120pxと仮定します。
CSSの場合
#section01 { margin-top:-120px; padding-top:120px; }
javascriptの場合 ※jQueryを使用
$(function () { var headerH = 120; //ヘッダーの高さ $('a[href^=#]').click(function(){ var href= $(this).attr("href"); var target = $(href == "#" || href == "" ? 'html' : href); var position = target.offset().top-headerH; $("html, body").animate({scrollTop:position}, 550, "swing"); return false; }); });
お試しください。